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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

【抗疫中我们众志成城㉖】河北：家庭巡诊小分队守护健康******

　　【抗疫中我们众志成城㉖】

　　光明日报邯郸12月21日电（记者耿建扩、陈元秋）“目前，俺妈已转阴，妻子的身体也很健康。”12月21日，河北省邯郸市峰峰矿区新坡镇王庄村村民王强那颗揪着的心终于放下了，言语间感慨不已。

　　就在几天前，王强一度很紧张。为啥？因为其母亲身体出现了发热症状，而此时妻子孕期18周。如何既做好对母亲的护理，又防止交叉感染？面对难题，王强一下子慌了神。情急之下，他拨通了村家庭巡诊小分队的电话。“不要急，我先给你讲清防护注意事项。待会儿我就带着药品过来！”村家庭巡诊小分队医生李平海在电话中快言快语。不到十分钟，身背药箱的李平海已风风火火出现在王强家中。

　　“每位村民都在巡诊网格内，我跟村干部王丽组成一组，负责村东163户村民，群众有需求，我们不分昼夜做到15分钟内马上到。”李平海说。

　　“目前，家庭巡诊小分队已覆盖全市所有乡村（社区）。”邯郸市卫健委副主任周海英说，为保障群众身体健康，满足群众居家就医需求，12月6日以来，卫健部门科学配置医疗力量，以乡镇（街道）、村（社区）为单位，依托乡镇卫生院、村卫生室、社区卫生服务中心（站），组织9425名医务人员和村、社区干部，组建了4186支家庭巡诊小分队，为居家群众提供健康科普、心理疏导、随访巡诊、上门送医送药、研判病情、信息上报、协助转诊等医疗服务保障。

　　如今，笑容又回到王强憨厚的脸上。“随着症状的变化，我母亲需要吃啥药、我媳妇怎样预防，随时问李医生就好。”

　　“强子，你电话要的酒精，还有一些常用药，我挂门上了，有啥事给我打电话。”瞧，一大早，李平海就与他的家庭巡诊小分队又来巡诊了。如今，4186支家庭巡诊小分队正以繁忙的脚步编织着一张横到边、竖到底的网格，全力以赴保障着群众的身体健康和生命安全。

　　《光明日报》（ 2022年12月22日 04版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）